福建师范大学心理健康指导中心是学校立足全体学生实施心理健康教育的专门机构。本中心将以“助人自助”为宗旨，以发展、自助、保密、尊重为原则，以维护在校大学生的心理健康、全面提高大学生的心理素质为目的，承担着对全校学生宣传、普及心理健康知识，组织心理健康教育活动，开展心理咨询，调查大学生心理健康状况的工作任务。其工作职责主要包括：
1. 每三个月编辑一期《清心源》报纸，发放到学生宿舍，《清心源》是由校学工部、校关工委主办、教科院心理咨询中心协办的一份科普性报纸,目的在于用通俗易懂语言对全校学生宣传心理健康方面的知识；
2. 开展新生心理普查及心理档案的建立。每年新生入学伊始，中心即组织全校新生心理普查，建立新生心理档案，以便全面了解新生心理健康状况，并结合学生实际，定期或不定期地对新生开展关于心理健康专题的入学教育，提高新生心理保健意识；
3. 开设心理健康基本知识、大学生人际交往等面向全校学生的公共选修课程；从而增强学生助人与自助的能力；
4. 开展心理咨询，接待那些主动通过电话预约或直接到本中心办公室室进行咨询的学生；
5. 指导学生心理健康发展性的社团组织（如心理健康协会，班级心理健康宣传员）的成员如何对那些需要帮助的同学进行朋辈个体咨询、团队辅导、电话咨询等；
6. 组织开展心理健康教育活动，例如：每年五月份举行的“5.25（我爱我）心理健康月”都会以海报、广播、宣传栏、心理剧院、心理测试、心理小品剧等各种形式向全校同学普及心理健康的知识；
7. 举办教师心理健康教育培训班——辅导员心理健康教育培训，从而为辅导员在从事具体学生工作中提供理论基础，
8. 开展与学校心理健康教育有关的科研，为学校管理部门提供相应的决策依据。